Школа начинается как сельское церковно-приходское училище при храме во имя Святителя и чудотворца Николая в селе Большое Кривощёково Томской губернии.
Когда в 90-х годах позапрошлого века строился железнодорожный мост через Обь, село Большое Кривощёково было снесено и частично перенесено в деревню Бугры, в нескольких километрах от него. Перенесено было и здание Никольской церкви, освящённое вновь в 1895 году.
Информация, найденная на сайте МБОУ СОШ № 128 г. Новосибирска: «Это была самая первая школа в Новосибирске. До 1916 года обучение велось раздельное. Сколько обучалось девочек — не установлено, а мальчиков было 69. С 1916 года одноклассное сельское училище преобразовано в двухклассное смешанное училище. К концу 1920 года оно становится колхозно-заводской школой 1-й ступени. В 1929-м она стала фабрично-заводской семилетней школой № 3 имени крайисполкома с землеустроительным уклоном. С 1934-го — Бугринской средней школой Заобского района. С 1937-го — школой № 63 Кировского района».
В 1959 году была открыта школа № 128, а школа № 63 стала восьмилеткой, затем начальной школой, в последствии школа закрыта. Деревянные, потемневшие от времени, здания школы ещё стояли какое-то время среди старого заросшего школьного сада, а потом и их снесли.
Возникновение Новосибирска связано со строительством Транссибирской железнодорожной магистрали. Датой рождения города считается 1893 год - год закладки железнодорожного моста через реку Обь. К тому времени на левом берегу Оби был лишь небольшой посёлок Кривощёково, а на правом - деревня Гусевка. Крохотная полевая станция Кривощёково имела тогда одну улицу, прижатую к вокзалу болотами и камышами.
Бугры - самое древнее место, где поселился народ раньше города Новосибирска и Кривощёково.
В документах, которые сохранил житель села Г.И. Юдин во время пожара в церкви, в отчете школы за 1907 год написано: «Бугринское сельское одноклассное училище основано в 1862 году».
Кто был первым учителем - не установлено. Вначале школа размещалась в маленькой церковной сторожке, а затем несколько лет - в наёмном помещении, в доме Безмылова.
В 1873 году школа обзавелась новым помещением. В отчете за 1907 год записано, что на 1 января этого года в школе обучалось 56 мальчиков, к 1 января 1908 года - 68 мальчиков. Учительницей и заведующей в это время была Фёдорова Александра Семёновна и её брат Фёдоров Фёдор Семенович. Он читал Закон Божий.
Школьное здание было построено в 1906 году здание на средства от прихода.
До 1916 года обучение велось раздельное, сколько обучалось девочек - не установлено.
С 1916 года одноклассное сельское училище было преобразовано в двухклассное смешанное училище. Мальчики и девочки обучались вместе. В 1910 году мальчиков обучалось 73 чел., девочек 29 чел.
Заведующей школой была Лебедкина Мария, учителя - Никольская А. и Котова Анна Александровна.
Средства, на которые содержалась школа: от Министерства 18000 руб., от Земства 14400 руб., от Сельского общества 1700 руб. Всего за год 34100 руб.
В 1917 году в школе обучалось 117 человек. Наступила революция, пришли колчаковцы и школе снова пришлось плохо: все заботы о помещении для учителей, о ремонте, отоплении и освещении, о плате уборщицам снова пришлось взять на себя крестьянам.
В 1918 году было открыто в школе пять отделений с числом учащихся 167 чел. Заведующим школой в то время был Хазов Фёдор Филиппович. Жив старичок, живет в городе, это лето с ним беседовала Анна Адамовна. Учителями в это время работали: Козьмина Елизавета Андреевна и Телятникова Лидия Ивановна.
К концу 1919-20 учебного года школа была преобразована в колхозно-заводскую (завод Коптелова) школу 1-й ступени. В ней обучалось 240 учащихся: мальчиков 160 чел., девочек 80 чел. (заведующий школой - Баско С. С., учителя: Ярс М. В., Телятникова Лидия Ивановна, Проминская Зоя Васильевна.